精巧的外觀修飾，搭配全新「極光紫」烤漆色，讓小改款CR-Z充滿了精緻感。
2013年式CR-Z以一系列造型上的升級識別，強調其運動化的訴求；重視設計造型的車迷，將會被CR-Z嶄新的前保桿設計所吸引，前保桿並圍繞著一組修飾過的水箱護罩。車尾後保桿整合一全新分流器的設計，而具強烈視覺印象的17吋鋁圈，更與輪拱的造型相輔相成；兩款全新車體色─活力黃與極光紫也更強化CR-Z的時髦感受。Honda也以新的色彩搭配提升CR-Z的內裝視覺感受，另外也修改了車內門板的設計，以強化車室內的收納機能。
1.5升四缸汽油引擎藉由ECU、可變汽門正時機構、與曲軸材質的變更，使得最大馬力再上漲7ps。
CR-Z的1.5升汽油引擎更換了可變汽門正時系統與ECU，並追加一具防爆震感知器，此外曲軸的製造材質也一併升級，使得這具引擎的最大馬力從114ps小幅提升為121ps；電動馬達系統也一併經過改良，原搭載的鎳金屬hybrid(Ni-MH)電池模組也更換為鋰電池模組，出力並從14ps上漲為20ps。
整合式馬達輔助(IMA、Integrated Motor Assist)的hybrid傳動系統，現提供CR-Z 137ps / 6,600rpm與190Nm(約19.37kg-m)的總合輸出，較改款前車型分別增加了13ps與16Nm(約1.63kg-m)的輸出，此外在0-62mph(約99.76km/h)的加速表現更從9.7秒降為9秒整，極速則高達124mph(約199.52km/h)；CR-Z的綜合平均油耗表現為20km/l，碳排放值則為116g/km。
方向盤輻右側的「S+」電子增壓按鍵，能使CR-Z擁有最多10秒的加速輔助功能。
為協助駕駛人善用CR-Z的運動性能，Honda追加了Plus Sport(S+)增壓系統，當電池電力大於50%時，駕駛人能藉由按壓方向盤上的S+按鈕來啟動這項功能，當油門一踩、電子增壓也隨之而來，協助強化加速的表現最多達10秒，而啟用S+功能時，儀表也會跟著閃爍；此外，S+均可在ECON、Normal、Sport等行車模式下使用。
小改款2013年式Honda CR-Z除了強化其運動化訴求外，其優異的油耗經濟性、與低排污的表現更是絲毫沒有妥協。
